Lindur në Como, Itali në 1702 me lindje fisnike. Në Spanjë, ku ai arrin duke ikur nga lufta austriake, ai merr fuqi të gjera për të mbledhur pensionin e pasardhësve të Moctezumës në Royal Cajas të Meksikës.
Ai udhëtoi në Spanjën e Re në 1736. Gjatë tetë viteve të qëndrimit të tij ai iu përkushtua vetes për të hetuar shfaqjet e Virgjëreshës së Guadalupe, duke mbledhur materiale të konsiderueshme grafike dhe piktografike. Ajo promovon kurorëzimin e imazhit të Guadalupanës, e cila shkakton mosbesim tek autoritetet nënvendore. Ai është zënë rob dhe koleksioni i tij është hequr. Muaj më vonë, pasi u dëbua në Spanjë, ai hipi në një anije që bie në duart e piratëve që e braktisin atë në Gjibraltar.
Me vepra të shkëlqyera ai arriti në Spanjë dhe ra në kontakt me koleksionistin Mariano Fernández de Echeverríay Veytia i cili arriti pafajësinë e tij duke u quajtur Kronist Mbretëror i Indive, një pozicion që Boturini e refuzoi për t'iu kushtuar shkrimeve për historinë e popujve indigjenë. Megjithëse nuk e rimori kurrë koleksionin e tij, ai shkroi Katalogun e Muzeut Indian në të. Puna e tij është shumë origjinale dhe e dokumentuar mirë. Ai vdiq në Madrid në një datë të pasigurt, midis 1750 dhe 1755.
