Hidalgo u nis për në Aguascalientes dhe mori kursin për Zacatecas. Këtu u përcaktua që udhëheqësit kryesorë, me trupat më të mira dhe paratë, u larguan për në Shtetet e Bashkuara.
Sapo ishin rrugës, ata u zunë robër nga Royalistët në 21 Mars në Norias del Baján ose Acatita del Baján. Hidalgo u dërgua në Monclova, nga atje ai u largua në 26 Mars përmes Alamo dhe Mapimí dhe më 23 ai hyri në Chihuahua. Pastaj u formua procesi, dhe më 7 maj u mor deklarata e parë. Karakteri kishtar i Hidalgo bëri që procesi i tij të vonohej më shumë sesa ai i shokëve të tij.
Dënimi për ulje u shqiptua më 27 korrik dhe më 29 korrik u ekzekutua në Spitalin Mbretëror ku u burgos Hidalgo. Këshilli i Luftës dënoi të burgosurin që të vihej në armë, jo në një vend publik si shokët e tij, dhe duke e qëlluar atë në gjoks dhe jo në shpinë, duke ruajtur kokën e tij. Hidalgo e dëgjoi fjalinë me qetësi dhe u përgatit të vdiste.
Dita e tij e fundit është përshkruar si më poshtë: “Kthehu në burgun e tij, ata i shërbyen një mëngjes me çokollatë dhe pasi e morën atë, ai u lut që në vend të ujit të shërbehej një gotë qumësht, të cilën e përfundoi me një shfaqje të jashtëzakonshme oreksi dhe kënaqësie. Një moment më vonë i thanë se kishte ardhur koha për të shkuar në tortura; Ai e dëgjoi atë pa ndonjë ndryshim, u ngrit në këmbë dhe deklaroi se ishte gati të largohej. Ai doli, në fakt, nga kubi i neveritshëm në të cilin ndodhej, dhe pasi kishte përparuar pesëmbëdhjetë apo njëzet hapa larg tij, ai u ndal për një moment, sepse oficeri i rojes e kishte pyetur nëse i ofrohej ndonjë gjë për të hedhur më së fundmi; Për këtë ai u përgjigj po, se donte që ata t'i sillnin disa ëmbëlsira që ai i kishte lënë në jastëkët e tij: ata me të vërtetë i sollën ato, dhe pasi i shpërndanë në të njëjtët ushtarë që do t'i vinin zjarr dhe po marshonin pas tij, ai i inkurajoi dhe i ngushëlloi me faljen e tij dhe fjalët e tij më të ëmbla që ata të përmbushin detyrën e tyre; Dhe pasi ai e dinte shumë mirë që ishte urdhëruar të mos qëllonte kokën e tij, dhe kishte frikë se do të vuante shumë, sepse ishte akoma muzg dhe objektet nuk shiheshin qartë, ai përfundoi duke thënë: "Dora e djathtë që unë do të vendos në gjoksin tim do të jetë , fëmijët e mi, objektivi i sigurt në të cilin duhet të shkoni ”.
“Stoli i torturave ishte vendosur atje në një korale të brendshme të shkollës së referuar, ndryshe nga sa u bë me heronjtë e tjerë, të cilët u ekzekutuan në sheshin e vogël prapa ndërtesës së përmendur, dhe aty ku është monumenti sot. që na kujton atë, dhe qendrën e re tregtare që mbante emrin e tij; dhe kur Hidalgo e dinte për vendin në të cilin ai ishte drejtuar, ai marshoi me një hap të vendosur dhe të qetë, dhe pa lejuar që sytë e tij të lidheshin me sy, duke u lutur me një zë të fortë dhe të zjarrtë psalmin Miserere me; Ai arriti te skela, e puthi me dorëheqje dhe respekt, dhe megjithë disa grindje që nuk e bënin të ulej me shpinë të kthyer, ai zuri vendin nga ana e përparme, afirmoi dorën në zemër, u kujtoi ushtarëve se kjo ishte pika ku ata duhet ta gjuajnë atë, dhe një moment më vonë shpërtheu shkarkimi i pesë pushkëve, njëra prej të cilave shpoi në mënyrë efektive dorën e djathtë pa dëmtuar zemrën. Heroi, pothuajse i pandryshueshëm, e tensionoi lutjen e tij dhe zëri i tyre u qetësua kur u shpërthyen përsëri pesë surrat e pushkës, plumbat e të cilëve, duke kaluar trupin, thyen lidhjet që e lidhnin atë në stol dhe burri ra në një liqen gjaku, ai ende nuk kishte vdekur; tre plumba të tjerë ishin të nevojshëm për t'i dhënë fund asaj ekzistence të çmuar, e cila kishte respektuar vdekjen për më shumë se 50 vjet ".
Koka e tij, me ato të Allende, Aldama dhe Jiménez, u vendos në kafaze hekuri në cepat e Alhóndiga de Granaditas në Guanajuato. Trupi u varros në rendin e tretë të San Francisco de Chihuahua, dhe në 1824 trungu dhe koka u sollën në Meksikë, për t'u varrosur me shumë solemnitet.
